Além das mensagens, Nossa Senhora prometeu confiar ao vidente Marcos Tadeu Treze Segredos.
Até hoje Nossa Senhora revelou doze, dos treze segredos. Disse que quando revelar todos, não virá mais todos os dias, como faz agora, mas uma vez por ano, no aniversário das Aparições, em 7 de fevereiro, ou no dia do seu aniversário, 12 de fevereiro, até o final da vida de Marcos Tadeu. Quem determinará a data é a divina vontade.
Os Segredos referem-se a acontecimentos que alcançarão a toda a humanidade. Marcos não poderá revelar jamais o conteúdo dos segredos sem a permissão de Nossa Senhora. Ao ser perguntado, Marcos apenas responde que são bons para uns e maus para outros.
Do quanto se pode falar, Nossa Senhora permitiu ao vidente adiantar aproximadamente o que serão, mas nada a respeito da forma como ocorrerão. Nossa Senhora falou que os três primeiros segredos são avisos para a humanidade.
O Primeiro e o Segundo Segredos são avisos para a humanidade, a fim de que se converta e volte para Deus. O terceiro segredo refere-se a um grande sinal que a Virgem dará ao mundo inteiro, e que todos o verão e acreditarão que Deus existe, contudo, já será tarde demais para a conversão de muitos. Este sinal será de tal modo milagroso, inexplicável e indestrutível, que até o coração mais duro não poderá resistir em acreditar que veio de Deus. Contudo, não mais se converterão, um vazio insuportável invadirá as almas destas pessoas, quando “arrancarão os cabelos da sua cabeça, e amaldiçoarão a sua vida levada sem Deus”, como disse Nossa Senhora, mas já será tarde.
Ficará um sinal permanente, indestrutível e claro deste grande milagre em muitos locais em que a Santíssima Virgem verdadeiramente apareceu. Em alguns locais ele será palpável, em outros não.
Quanto aos outros segredos, serão castigos que sobrevirão à humanidade, logo após o grande sinal, caso esta não se converta a ele. Portanto, a humanidade tem até o surgimento do sinal para se converter. Aqueles que não se converterem até ele, não conseguirão mais se converter, e terão de enfrentar os castigos devidos aos próprios pecados. Os piores são o quarto, o nono, o décimo e o décimo-primeiro.
Alguns segredos também se referem a coisas boas. O quinto se refere somente à vida de Marcos Tadeu, e jamais deverá ser revelado a ninguém. Portanto, ficam doze segredos a serem revelados à humanidade.
Será que algum se refere à Igreja, ao Brasil, ao estado de São Paulo ou à cidade de Jacareí? Não sabemos, pois até agora, Marcos Tadeu não revela nem dá mais nenhuma pista sobre a que se referem. A Santíssima Virgem diz que o tempo que resta para a realização dos segredos é muito curto e, em breve, eles deverão se verificar. Por isso, o tempo de graça é agora e, aqueles que não o aproveitarem para a sua conversão, não a conseguirão mais.
Depois que se realizarem todos os segredos preditos, a força de Satanás será destruída, com o seu aniquilamento no inferno, e virá ao mundo o Triunfo do Imaculado Coração de Maria, profetizado desde Fátima, e amplamente confirmado em Jacareí.
As pessoas que irão viver neste tempo de Paz e Santidade que virá ao mundo, com o triunfo do Imaculado Coração de Maria, serão aquelas que agora, hoje, se converterem e puserem em prática as mensagens da Santíssima Virgem e do Sagrado Coração de Jesus. Segundo a Santíssima Virgem, menos de um terço da humanidade se salvará, porque o pecado do mundo é muito grande e muito poucos se convertem. Por isso, temos que rezar incessantemente pela conversão dos pecadores e pela salvação das almas do mundo inteiro, pois, só assim, poderemos estar contribuindo para que a misericórdia de Deus toque o maior número de almas possível.